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基于机器学习算法构建中重度围绝经期综合征预测模型

发表时间:2024年08月31日阅读量:156次下载量:102次下载手机版

作者: 张敏 顾婷婷 关蔚 刘想想 施君瑶

作者单位: 上海市浦东新区妇幼保健院(中心)妇女群体保健科(上海 201206)

关键词: 围绝经期综合征 围绝经期妇女 机器学习 预测

DOI: 10.12173/j.issn.1004-5511.202405116

基金项目: 基金项目: 上海市浦东新区卫生健康委员会面上项目(PW2020A-79);上海市浦东新区第二轮医学学科建设项目(PWYgts2021-02)

引用格式:张敏,顾婷婷,关蔚, 刘想想, 施君瑶. 基于机器学习算法构建中重度围绝经期综合征预测模型[J]. 医学新知, 2024, 34(8): 871-879. DOI: 10.12173/j.issn.1004-5511.202405116.

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摘要|Abstract

目的  通过机器学习算法筛选围绝经期妇女发生围绝经期综合征(perimenopausal syndrome,PMS)的影响因素,构建围绝经期妇女中重度PMS发生风险的预测模型。

方法  选取上海市浦东新区48个社区的围绝经期妇女作为研究对象,并根据Kupperman评分量表评价结果分为PMS正常或轻度组和中重度组。将数据随机分为训练集和测试集,使用Boruta算法和SHAP算法进行特征选择。使用逻辑回归(Logistic regression,LR)、随机森林(random forest,RF)、支持向量机(support vector machine,SVM)和梯度提升决策树(gradient boosting decision tree,GBDT)构建模型,并采用精确度、准确度、召回率、受试者工作特征曲线的曲线下面积(area under curve,AUC)、F1分数评估模型性能。

结果  共纳入围绝经期妇女856例,其中PMS正常或轻度组557例、中重度组299例;训练集599例、验证集257例。使用Boruta算法以及SHAP算法纳入在职情况、运动、年龄、月经情况、就诊史、超重、居住地、健康教育史、户籍9个特征作为最终模型的预测变量。参数调优后,LR、RF、SVM、GBDT算法基于训练集的10折交叉验证的AUC分别为0.64、0.77、0.74、0.77。LR、RF、SVM、GBDT算法在测试集中的AUC分别为0.63、0.69、0.69、0.73;召回率分别为0.59、0.55、0.55、0.62。

结论  构建的围绝经期妇女中重度PMS发生风险预测模型中,GBDT算法的预测表现最优,具有一定的预测价值,可为围绝经期妇女发生中重度PMS的早期识别和干预提供新思路和方法。

全文|Full-text

围绝经期综合征(perimenopausal syndrome,PMS)是指女性在围绝经期由于卵巢功能减退和激素水平波动而引发的一系列身心症状,包括潮热、盗汗以及失眠等[1-2]。研究表明,约有70%~80%的围绝经期妇女会有不同程度的PMS症状,其中约20%的妇女症状较为严重,影响其日常生活和工作[3]。针对PMS的干预措施主要包括药物治疗、生活方式干预和心理治疗等[4-6]。然而,药物治疗可能带来副作用以及增加并发症的风险[7];生活方式干预和心理治疗的长期依从性也较差。

将健康管理的重点从疾病治疗转移到疾病预防和健康促进,有效预测PMS发生风险进而采取措施预防PMS的发生是应对PMS的有效策略之一[8]。人工智能,尤其是机器学习技术的发展,为解决上述问题提供了新的可能。机器学习通过从大数据中发现潜在的模式和规律的方式对事件进行预测[9]。例如,在围绝经妇女人群中,Wang等[10]基于健康检查数据开发了能够早期识别代谢综合征高风险人群的机器预测模型;Ali等[11]构建了能够预测围绝经期妇女抑郁症的机器学习模型。然而,目前尚缺乏使用机器学习模型预测围绝经期妇女PMS发生风险的研究。因此,本研究利用机器学习技术构建围绝经期妇女PMS发生风险的预测模型,以期为围绝经期妇女PMS的预防和健康管理提供参考。

1 资料与方法

1.1 研究对象

本研究以围绝经期妇女为研究对象。2022年7月至2023年6月,对上海市浦东新区辖区内48个社区的围绝经期妇女进行调查。纳入标准:①社区常住妇女;②年龄40~60周岁;③在10个月之内发生两次相邻月经周期长度的变化大于7 d,绝经定义为月经停止超过12个月[12]。排除标准:①有严重器质性疾病;②有精神疾病或心理障碍;③临床结局无法判断者;④正在服用可能影响PMS症状的药物者(如激素替代治疗等);⑤不能理解调查内容或无法有效沟通者。本研究经上海市浦东新区妇幼保健中心伦理委员会审批[批号:(2020)伦理第(005)号],并获得研究对象知情同意书。

1.2 资料收集

在参考相关文献的基础上自行设计问卷内容,包含:①一般人口学资料,包括年龄、居住地(城镇或农村)、户籍、职业(工人、公司职员、国家公务员、科技人员、医务人员、教师、私营业主以及家庭主妇)、教育程度、经济状况、在职情况、是否照看儿童、是否超重、是否不规律运动(规律运动定义为每周至少进行三次中等强度运动,每次至少30 min)、是否抽烟(每周吸烟至少一次,每次至少一根香烟)、是否饮酒(每周饮酒至少一次,每次饮酒至少一杯)等;②月经婚育史,包括是否绝经、婚姻状况;③围绝经期相关因素,包括健康教育史(接受关于围绝经期健康的教育或培训)、对更年期态度、就诊史(是否有过针对围绝经期相关症状的就诊记录)等;④围绝经期症状和PMS严重程度。

参考《更年期妇女健康管理专家共识(基层版)》[13],使用改良版Kupperman评分量表评估PMS的严重程度[14]。该量表评估13项症状,包括潮热出汗、感觉异常、失眠、易激动、抑郁、头晕、疲乏无力、骨关节肌肉痛、头痛、心悸、皮肤蚁走感、性交痛和泌尿系统症状。每个条目评分以症状程度乘以症状指数,其中潮热出汗的症状指数为4,感觉异常、失眠、易激动、性交痛、泌尿系症状的症状指数为2,其余症状指数为1[15]。总分范围为0~63分,>30分为重度、16~30分为中度、6~15分为轻度以及<6分为正常[14]。根据评估结果,将研究对象分为PMS正常或轻度组和PMS中重度组。

1.3 质量控制

调查场所为上海市浦东新区辖区内48个社区的社区卫生服务中心。调查员均为社区卫生服务中心在职医生,且经过统一培训,培训内容包括语言规范性和标准、调查的目的和意义、调查问卷的条目解释及填写方式等。通过对在社区卫生服务中心门诊就诊或参加专题讲座的研究对象随机分发调查问卷和知情同意书。问卷以匿名方式,由调查对象独立完成,调查员当场答疑、回收、核查。缺失内容超过20%的问卷予以剔除。共发放893份问卷,最终回收有效问卷856份,有效回收率为95.86%。

1.4 统计学分析

采用Python 3.10.9软件对数据进行分析。分类变量使用频数和百分比(n,%)表示,组间比较采用χ2检验或Fisher精确检验,多分类变量采用“独热编码”的方式转换为二分类变量,以更好地适用于机器学习算法。在拟合模型前,使用众数对缺失率不足20%的数据进行缺失值插补,使用标准化法对数据进行缩放,使用SMOTE算法处理不平衡数据[16],并按照7 ∶ 3的比例把数据随机分为训练集和测试集,使用Boruta算法和SHAP算法进行特征选择[17-18]。基于训练集,使用逻辑回归(Logistic regression,LR)、随机森林(random forest,RF)、支持向量机(support vector machine,SVM)和梯度提升决策树(gradient boosting decision tree,GBDT)4种算法构建围绝经期妇女发生中重度PMS的风险预测模型。使用Optuna算法进行超参数选择,然后基于训练集进行10折交叉验证评估预测模型性能,同时在测试集上验证预测模型的性能。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线的曲线下面积(area under curve,AUC)、精确度、准确度、召回率、F1分数等指标评价模型性能。P <0.05表示差异有统计学意义。

2 结果

2.1 一般情况

纳入856名围绝经期妇女,其中PMS正常或轻度组557人,PMS中重度组299人。年龄、学历、是否公司职员、在职情况、是否照看儿童、是否超重、月经情况、是否不规律运动、是否饮酒以及就诊史在两组间具有显著差异(P<0.05)。

按照7 ∶ 3随机将原始数据集分为训练集和测试集,其中训练集599例(PMS正常或轻度393例,PMS中重度206例),验证集257例(PMS正常或轻度164例,PMS中重度93例)。PMS发生情况及各特征在两个数据集间无显著差异,具体见表1。

  • 表格1 不同组别和数据集中围绝经期妇女基线特征情况(n,%)
    Table1.Baseline characteristics of perimenopausal women in different groups and datasets (n, %)
    注:#职业为多分类变量,经独热编码处理;*组间比较采用Fisher精确检验。

2.2 机器学习特征选择

基于RF算法,分别使用Boruta算法和SHAP算法计算排名前10的主要特征,然后求两种算法的交集。由图1可知,两种算法计算获得的前10个重要特征中均包含在职情况、运动、年龄、月经情况、就诊史、超重、居住地、健康教育史、户籍共9个特征。因此,将该9个特征作为机器学习算法的输入特征。

2.3 模型超参数调优

基于训练集,采用10折交叉验证分别在默认超参数和使用Optuna算法调优情况下,将筛选的9个特征作为输入特征,以AUC为评价指标评价模型性能。结果显示,LR、RF、SVM和GBDT在超参数调优前的AUC分别为0.64、0.75、0.71和0.76,在参数调优后的AUC分别为0.64、0.77、0.74和0.77。参数调优后,除LR外,其他模型的AUC均有所提升,见图2。

  • 图1 Boruta算法与SHAP算法特征选择
    Figure1.Feature selection based on Boruta algorithm and SHAP algorithm
    注:A. 基于Boruta算法的特征重要性排名前10的特征(条形图越短,排名越靠前);B. 基于SHAP算法的特征重要性排名前10的特征;C. Boruta算法与SHAP算法获得的前10个重要特征的交集;ES. 在职情况;Exercise. 运动;Age. 年龄;MC. 月经情况;MH. 就诊史;Obese. 超重;Area. 居住地;HHE. 健康教育史;HHR. 户籍;Childcare. 照看儿童;CE. 公司职员。

  • 图2 各模型10折交叉验证的ROC曲线
    Figure2.ROC curves of ten-fold cross validation for each model
    注:A. 默认超参数下各模型的10折交叉验证的ROC曲线;B. 调参后的各模型10折交叉验证ROC曲线;LR. 逻辑回归;RF. 随机森林;SVM. 支持向量机;GBDT. 梯度提升决策树。

2.4 模型验证

经模型调优确认最终的超参数后,基于测试集对模型性能进行评估。LR、RF、SVM和GBDT在测试集中的AUC分别为0.63、0.69、0.69和0.73(图3-A);4种模型的召回率分别为0.59、0.55、0.55以及0.62(图3-B)。各模型基于准确度、精确度以及F1分数的表现,具体见表2。其中GBDT模型的综合表现最好,其基于测试集的准确度、精确度以及F1分数分别为0.67、0.56以及0.59。

  • 图3 基于独立测试集的模型性能评估
    Figure3.Model performance evaluation based on independent test sets
    注:A. 基于测试集的各模型性能验证ROC曲线;B. 基于测试集的各模型的召回率;LR. 逻辑回归;RF. 随机森林;SVM. 支持向量机;GBDT. 梯度提升决策树。

  • 表格2 各模型评价指标结果
    Table2.Results of evaluation indicators for each model
    注:LR. 逻辑回归;RF. 随机森林;SVM. 支持向量机;GBDT. 梯度提升决策树。

3 讨论

本研究利用机器学习算法,基于上海市浦东新区围绝经期妇女的流行病学调查数据,构建了中重度PMS发生风险的预测模型。研究结果表明,经过超参数调优后,相较于其他3种模型,GBDT算法的预测表现最优,AUC为0.73,召回率和F1分数分别为0.62和0.59,准确度为0.67,具有较好的综合性能,模型对阳性结果的识别度有显著提升。

以往关于PMS的研究主要集中在其发病机制、症状评估及治疗措施等方面[19-22],缺乏对PMS发生风险预测的研究。本研究基于机器学习模型提供了一种新的预测中重度PMS的方法,为围绝经期妇女的健康管理提供了新思路。此外,通过预测模型可以在社区保健中心或妇幼保健院进行大规模筛查,及时发现高风险个体并提供相应的预防和治疗措施。这种模式在公共卫生管理中尤为重要,可以减少医疗成本,提高整体健康水平。现有研究的诊断工具只能判断当前,否患有中重度PMS,无法预测未来患病风险,而机器学习模型可以根据既往数据预测未来患病可能性,对高危人群提前进行健康干预,从而实现“治未病”的目标[23]。在PMS普查中,可以先使用诊断工具筛查当前患者,再用机器学习模型预测高危人群,或先用模型筛查高危对象,再用诊断工具确认当前病情,从而提高筛查效率。

本研究综合了两种特征重要性算法,对纳入机器学习的特征进行了筛选。最终,在职情况、运动、年龄、月经情况、就诊史、超重、居住地、健康教育史以及户籍等9个特征被纳入模型。上述大部分特征在以往的研究中已被证实与PMS发生风险相关。例如,年龄是影响PMS发生的重要因素,随着年龄增长,PMS的发生率逐渐升高;超重与内分泌紊乱、炎症反应等密切相关,也是PMS的危险因素[12, 24],在本研究中,无论是基于单因素分析还是基于SHAP算法的结果,都支持上述结论。此外,刘红雪等[25]的研究表明,绝经后PMS的患病率显著高于正常月经和绝经过渡期的患病率,并且PMS的患病率在接受教育情况、职业现状方面的差异具有统计学意义,本研究的结果也具有一致性;然而,该研究指出郊区女性患病率显著高于城区,而本研究结果显示,居住地不同(城镇/郊区)的研究对象,中重度PMS的患病率无显著差异,这种结果的差异或可归因于地区间发展的不平衡。另外,已有系列研究表明运动对于围绝经期妇女的健康具有积极意义。比如,方梦辰等[26]的研究表明中低强度的有氧运动可对围绝经期和绝经后妇女心率变异性产生积极影响;也有研究表明增加体育运动可降低或缓解PMS的发生[27-28],该结论也和本研究具有一致性。除上述报道较多的PMS影响因素外,本研究还纳入了文献较少出现的“就诊史”以及“户籍”两个因素。综上,本研究纳入的中重度PMS相关影响因素,基本与文献报道一致,进一步提升了模型的可解释性,保证了模型的可靠性。

本研究仍存在一定局限性。一是样本量限制了模型的学习能力;二是特征选择存在不足,未能充分挖掘影响中重度PMS发生的所有潜在因素;三是模型选择和参数调优有待优化;四是研究对象的招募主要集中在社区卫生服务中心,研究对象的代表性可能不足。以上因素导致本研究模型的AUC、召回率等指标虽然在可接受范围内,但仍有较大提升空间。未来仍需扩大样本量和样本来源,探索更高效的算法以改善模型性能以及扩大模型的适用场景。

综上所述,本研究构建了基于机器学习算法的中重度PMS发生风险的预测模型,其中GBDT算法的预测表现最优,具有一定的预测价值,可为围绝经期妇女中重度PMS发生风险的早期识别和早期干预提供新的思路和方法。

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